- Лицей №36 ОАО "РЖД" структурных подразделений не имеет.
- Управление Лицеем осуществляет Учредитель.
- Единоличным исполнительным органом Лицея является директор Штепина Ольга Станиславовна, который осуществляет текущее руководство деятельностью Лицея.